Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUDCD3Q8IVD9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms