Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms