Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms