Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms