Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFKFB3Q16875 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PFKFB3Q16875 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms