Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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