Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms