Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms