Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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