Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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PTPRKQ15262 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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PTPRKQ15262 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
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PTPRKQ15262 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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PTPRKQ15262 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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