Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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