Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms