Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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