Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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HTR4Q13639 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms