Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms