Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms