Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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