Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms