Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms