Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDR1Q08345 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms