Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms