Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLEQ07864 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms