Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms