Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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