Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms