Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTGFP29279 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTGFP29279 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTGFP29279 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms