Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms