Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms