Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms