Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDGFRAP16234 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms