Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms