Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC4P09017 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC4P09017 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC4P09017 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms