Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG7O95352 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG7O95352 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms