Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms