Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCAO15360 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms