Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms