Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DGG1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DGG1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DGG1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DGG1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DGG1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DGG1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DGG1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DGG1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DGG1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DGG1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms