Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms