Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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