Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF24Q9UPV7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms