Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms