Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms