Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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