Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms