Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms