Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNRD1Q9P1U0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms