Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms