Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms