Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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