Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms